- Klaipeda.diena.lt inf.
- Teksto dydis:
- Spausdinti
VUL Santaros klinikos kartu su bendrove „Thermo Fisher Scientific Baltics“ atliko 8 iš daugiau kaip 4000 pagal tam tikrus laboratorinius požymius atrinktų ėminių SARS-CoV-2 viruso genomo sekoskaitą.
Kaip praneša Santaros klinikos, Jungtinėje Karalystėje pastebėtos naujos „rūpestį keliančios“ (angl. Variant of concern, VOC) viruso atmainos B.1.1.7 neaptikta. Visuose mėginiuose buvo iki šiol Lietuvoje sekoskaitos būdu neaptikta kita B.1.258 atmaina.
Gruodžio viduryje Jungtinėje Karalystėje buvo pastebėta nauja viruso atmaina (B.1.1.7 lineage arba angl. Variant of Concern, VOC). Nustatyta, jog ši viruso atmaina nukonkuravo kitas dominuojančias atmainas ir tapo viena iš dažniausiai aptinkamų Anglijos regione. Manoma, kad dėl jos stipriai išaugo susirgimų skaičius.
„Santaros klinikų medikai išanalizavo per 4000 Santaros klinikų laboratorijoje atliktų Lietuvos gyventojų viruso tyrimų teigiamus rezultatus, ir atrinko 8 mėginius, kuriuose pastebėtas S geno signalo praradimas, tikėtina, rodantis B.1.1.7 atmainą. Norint patvirtinti, ar Lietuvoje jau aptinkama naujoji „rūpestį kelianti“ atmaina, buvo nuspręsta atlikti šių ėminių viruso genomo sekoskaitą. Mėginiai buvo gauti iš Santaros klinikų biobanko“, – sako Santaros klinikų biobanko vadovas, vyresnysis medicinos biologas Daniel Naumovas.
Siekiant tikslumo sekoskaita buvo vykdyta dviejuose centruose: „Thermo Fisher Scientific Baltics“ ir Santaros klinikų Hematologijos, onkologijos ir transfuziologijos centre. Mėginius paruošė ir sekoskaitą atliko dr. Justinas Šlikas, vyresnysis „Thermo Fisher Scientific“ mokslo darbuotojas bei Santaros klinikų Hematologijos, onkologijos ir transfuziologijos centro medicinos biologas Rimvydas Norvilas, o gautų duomenų bioinformatinę analizę atliko Ingrida Olendraitė, Kembridžo universiteto virusų molekulinės biologijos ir bioinformatikos mokslininkė. Tyrimas atliktas naudojant „Thermo Fisher Scientific Baltics“ reagentus.
Kaip pranešama, patikrinus SARS-CoV-2 viruso atmainas, „rūpestį keliančios“ B.1.1.7 neaptikta. Visuose mėginiuose buvo rasta iki šiol Lietuvoje sekoskaitos būdu neaptikta B.1.258 atmaina, kuri duomenų bazėse siejama su Jungtine Karalyste, Danija ir Šveicarija. Lietuvoje aptikta B.1.258 ir Jungtinėje Karalystėje rasta B.1.1.7 atmaina turi bendrą mutaciją – S baltymo 69-70 aminorūgščių praradimą, kuris, manoma, atsirado dėl protrūkio, susijusio su ūkiuose auginamomis audinėmis.
Pasak Santaros klinikų Hematologijos, onkologijos ir transfuziologijos centro vadovo prof. Laimono Griškevičiaus, puikiai pavyko tikslingai atsirinkti mėginius, atlikti geros kokybės sekoskaitą ir tiksliai išanalizuoti duomenis. Viruso mutacijos ilgainiui gali daryti įtaką diagnostinių rinkinių tikslumui, viruso perdavimui (užkrečiamumui), vakcinų veiksmingumui. Šiuo metu lengviau, taigi ir greičiau plintančios VOC (arba B.1.1.7) atmainos nei Santaros klinikos, nei kolegos Vilniaus universitete ir Lietuvos sveikatos mokslų universitete išanalizuotuose Lietuvoje aptiktuose SARS-CoV-2 genomuose (~230; lapkričio-gruodžio mėn.) nerado. Tačiau šiuo metu, esant labai dideliam užsikrėtimų skaičiui, tokie pavieniai viruso genomo tyrimai yra nepakankami, todėl svarbu kuo greičiau pradėti nuolatinę viruso sekoskaitą Lietuvoje.
Iki šios dienos vadinamoji britiškoji COVID-19 atmaina aptikta jau 29 šalyse.
Apie B.1.258 atmainą
B.1.258 atmaina yra viena iš trijų žinomų viruso atmainų, kai pradingsta S-geno signalas, atliekant įprastinius viruso PGR tyrimus. Tai susieta su S baltymo 69-70 aminorūgščių praradimu ir dažniausiai aptinkama bent trijose skirtingose atmainų genomų atmainose (B.1.1 (taigi ir B.1.1.7), B.1.258 ir ‘cluster 5’). Taip pat šioje B.1.258 atmainoje aptinkama ir N439K (asparagino aminorūgštis, pakeista lizinu) mutacija S baltyme, kuri, manoma, padeda S baltymui stipriau prisijungti prie žmogaus ACE2 receptoriaus.
Apie B.1.1.7 atmainą
Susirūpinimą kelianti B.1.1.7 atmaina turi neįprastai didelį mutacijų kiekį (17), iš kurių 8 įvyko atsakingame už susijungimą su žmogaus ląstele – S gene. Pirmą kartą ši atmaina buvo aptikta Jungtinėje Karalystėje 2020 metų rugsėjį. Iki šios dienos toks pats virusas buvo aptiktas jau 29 šalyse. Pirminiai epidemiologiniai tyrimai rodo, kad B.1.1.7 atmaina siejama su išaugusiu užkrečiamumu. Šiuo metų nėra įrodymų, kad ši atmaina turėtų įtakos ligos sunkumui ar skiepų veiksmingumui.
SUSIJĘ STRAIPSNIAI
-
ES mirčių nuo koronaviruso skaičius viršijo 400 tūkstančių
Europos Sąjungoje (ES) nuo koronaviruso mirė jau daugiau kaip 400 tūkst. žmonių, antradienį pranešė už sveikatos apsaugą atsakinga eurokomisarė Stella Kyriakides. ...
-
Šiemet jau dešimčiai tautiečių transplantuoti inkstai
Antradienį, sausio 19-ąją, VUL Santaros klinikose vyksta inkstų transplantacijos procesas. Pirmadienį vakare šiose klinikose užregistruotas potencialus donoras, kurio artimieji sutiko velionio organus paaukoti donorystei. ...
-
Koronavirusas plinta gydymo įstaigose, įmonėse, šeimose, darželiuose
Per parą nustačius 717 naujų COVID-19 atvejų, Nacionalinis visuomenės sveikatos centras (NVSC) antradienį informavo, kad virusas plinta gydymo įstaigose, įmonėse. ...
-
Nuo COVID-19 paskiepyta didžioji dalis globos įstaigų gyventojų ir darbuotojų
Socialinės apsaugos ir darbo ministerija (SADM) tvirtina, jog šiuo metu nuo koronaviruso pirmąja doze jau paskiepyta didžioji dalis šalies globos namų gyventojų ir darbuotojų. ...
-
Statistikos departamentas laikinai neskelbia duomenų apie COVID-19 duomenis ligoninėse1
Statistikos departamentas laikinai neskelbia duomenų apie COVID-19 duomenis ligoninėse: nuo šios ligos gydomus pacientus, lovų užimtumą. ...
-
Praėjusią parą nuo koronaviruso mirė 40–89 metų žmonės
Praėjusią parą nuo COVID-19 mirė 18 žmonių, jiems buvo nuo 40 iki 89 metų, rodo antradienį paskelbti Statistikos departamento duomenys. ...
-
Vaistinės: per karantiną įsigyjama daugiau preparatų, skirtų mažinti nerimą, gerinti miegą1
Vaistinių tinklai karantino metu pastebi, kad gyventojai įsigyja daugiau preparatų, skirtų mažinti nerimą, gerinti miegą. Kai kurie tinklai pastebi, kad išaugo ir receptinių vaistų nuo nerimo, depresijos ar nemigos pardavimai. ...
-
Lietuvoje COVID-19 diagnozę išgirdo 717 žmonių, mirė dar 18 asmenų7
Statistikos departamentas antradienį pranešė, kad Lietuvoje per praėjusią parą patvirtinta 717 naujų koronaviruso atvejų. Nuo COVID-19 mirė 18 asmenų. ...
-
Ministras A. Dulkys žada iš esmės keisti vaistų kainyno peržiūros principus2
Sveikatos apsaugos ministras Arūnas Dulkys šiemet žada iš esmės keisti vaistų kainyno peržiūros principus ir siekti principo, kad gydytojas galėtų skirti pacientui geriausiai įmanomą vaistą. ...
-
SAM: pranešimų dėl galimų skiepijimo pažeidimų gauta, tačiau juose trūko informacijos3
Sveikatos apsaugos ministerija (SAM) teigia gavusi keletą pranešimų dėl galimų skiepijimo nuo COVID-19 prioritetų pažeidimų, tačiau juose trūko informacijos, todėl papildomų veiksmų nesiimta. ...