Savo profesinėje veikloje J. Zykus buvo vienas iš polinių pamatų įrengimo technologijos Lietuvoje pradininkų, už šią inovaciją buvo apdovanotas valstybine premija, pranešė viešoji įstaiga „Vilniaus metro“.

Pasak pranešimo, 1991 metais jis įkūrė ir vadovavo sudėtingų pamatų įrengimo įmonei „Vilniaus rentinys“. Jo vadovaujama įmonė apdovanota už 2008 ir 2010 metų Lietuvos metų gaminius.

Porą pastarųjų dešimtmečių J. Zykus skyrė Vilniaus metro idėjos įgyvendinimui, buvo visuomeninės organizacijos „Metro sąjūdis“ įkūrėjas ir vadovas.