Neramumai netolimose valstybėse, Rytų Europoje gerokai padidėjusi terorizmo grėsmė verčia koreguoti ir Klaipėdos uosto apsaugos planus.

Klaipėdos uostas saugomas pagal kompanijos „Science Aplications International Corporation“ parengtą uostų apsaugos planą. Jis atitinka ES 2004 metų direktyvas ir vėliau priimtus papildomus reikalavimus. Uostas yra laikomas saugiu, pasirengęs atremti galimas grėsmes ir teroristinius išpuolius. Ne kartą uoste rengtos ir įvairios pratybos.

Šiuo metu rengiamasi koreguoti uosto saugos planą. Tai verčia daryti ypač sparčiai vykdoma uosto rekonstrukcija. Per dešimtmetį atsirado daug naujų terminalų, kitų uosto infrastruktūros, kompanijų teritorinių veiklos padalinių pakeitimų. Ne visų jų saugumo sąlygos įvertintos atsižvelgiant į bendrą uosto saugos sistemą.

Paskelbtas konkursas parengti naują, griežtesnį Klaipėdos valstybinio jūrų uosto saugos planą. Pagal naująjį uosto apsaugos planą turės būti iš naujo saugumo požiūriu sertifikuotos uosto teritorijos, įvertinti objektai ir zonos, kuriems netaikomas saugumo (ISPS kodeksas), tačiau jie yra šalia teritorijų, kur toks kodeksas taikomas.

Taip pat bus apibrėžtos išskirtinės zonos, turinčios įtakos bendram uosto saugumui. Įvertintos ir galimos grėsmės bendram uosto saugumui.

Uoste yra numatyti nuo pirmojo iki trečiojo apsaugos lygiai.